Struktur Organisasi
| Ketua Departemen | : Prof. Dr. Eko Sri Wiyono, S.Pi, M.Si |
| Sekretaris | : Prof. Dr. Eko Sri Wiyono, S.Pi, M.Si |
| Kepala Tata Usaha | : Rena Manohara, S.I.P. |
| Ketua Program Studi TMPT | : Dr Didin Komaruddin, S.Pi, M.Si |
| Sekretaris | : Julia E. Astarini, S.Pi, M.Si |
| Ketua Program Studi TPL | : Prof. Dr. Ir. Ronny I. Wahju, M.Si |
| Sekretaris | : Dr. Vita Rumanti Kurniawati, S.Pi. MT |
| Kepala Divisi Sumberdaya dan Wilayah Perikanan Tangkap | : Prof. Dr. Ir. Ari Purbayanto, M.Sc |
| Kepala Divisi Kapal Alat dan Teknologi Perikanan Tangkap | : Prof. Dr. Ir. Mulyono S. Baskoro, M.Sc |
| Kepala Divisi Tata Kelola Perikanan Tangkap dan Kepelabuhan | : Prof. Dr. Ir. Tri Wiji Nurani, M.Si |
| Komisi Kemahasiswaan dan Disiplin | : Dwi Putra Yuwandana, S.Pi, M.Si
Tri Nanda C. Bangun, S.Pi, MSi |
| Komisi Penelitian dan PPM | : Dr. Roza Yusfiandayani |
| Komisi Kerjasama | : Dr. khmad Solihin |
| Koordinator Penelitian | : Dr. Ir. Muhammad Fedi A. Sondita, M.Sc |
| Sekretaris | : Dr. Am Azbas Taurusman, S.Pi., M.Si |
| Koordinator Kerjasama | : Dr. Ir. Budy Wiryawan, M.Sc |
| Sekretaris | : Dr. Ir. Darmawan, MAMA |
| Pimpinan Redaksi Jurnal Marine Fisheries | : Dr. Yopi Novita, S.Pi., M.Si
Dr. Vita R Kurniawati, S.Pi, MT |
| Redaktur Pelaksana | : Dr. Didin Komarudin, S.Pi., M.Si |
| Pimpinan Redaksi Jurnal Albacore | : Dr. Ir. Budhi Hascaryo Iskandar, M.Si
Dr. Fis Purwangka, S.Pi, M.Si |
| Redaktur Pelaksana | : Dr. Fis Purwangka, S.Pi., M.Si |
| Webmaster | : Dr. Fis Purwangka, S.Pi., M.Si |
| Admin | : Hamba Ainul Mubarok, S.Pi., M.Si |
| : Dwi Putra Yuwandana, S.Pi., M.Si | |
| : Siti Fina Nurcahyani |